Con el paso de los años la cruz del escudo se ha ido haciendo más gruesa y pasando del color rojo al granate, el balón se ha convertido en un balón histórico de los años 40 -haciendo referencia a la década de fundación del Club- y los colores de la banda lateral en la que se inscribe el nombre del Club se han suavizado hacia un azul celeste y un borde azul oscuro para el escudo. La cruz está tomada del escudo y bandera de la ciudad de Éibar, ciudad que se encuentra bajo patronazgo de este santo, así como del motivo central de la Ikurriña, ya que también aparece en color verde en la bandera. Dos históricos murales ubicados en el liceo República de México, creados por David Alfaro Siqueiros y Xavier Guerrero como regalo a la ciudad tras el terremoto de 1939, sufrieron profundas grietas y daños. Se trata de una gestión principalmente caracterizada por la concepción de los clubes de fútbol como empresas que deben ser rentables y que apostó por combinar el respeto a las raíces del club con la internacionalización. El ascenso a Primera División consolidó un modelo de gestión de clubs de fútbol, conocido con el nombre de «Modelo Eibar».
El estadio donde juega SD Eibar es el Estadio Municipal de Ipurúa, con capacidad para 8164 espectadores. Sin embargo en los cuartos de final cae derrotado frente al Atlético por 5-2 en el global, aunque hizo sufrir al equipo dirigido por el Cholo Simeone en la vuelta, empatando finalmente 2-2. En la parte institucional, el Club ha efectuado una nueva ampliación del Estadio Municipal de Ipurúa mediante el derribo y construcción de una nueva Tribuna Este, aumentando el aforo hasta los 7100 asientos. Los madrileños eran favoritos sobre el papel, sin embargo cayeron ante los pucelanos perdiendo por 2-1 en la ida y en la vuelta por 1-2 en un partido disputado en el Estadio de Chamartín. Independiente marco la mayor goleada de la historia de la Copa Argentina, el 20 de junio del 2018, en el Estadio Antonio Romero en Formosa, Goleo 8-0 a Central Ballester. Conquistó el Campeonato uruguayo de 1992 con gran actuación del panameño Dely Valdés y del argentino Antonio Vidal González. Le sigue con un gol menos Aníbal González con 118. Otros dos jugadores han marcado más de 80 goles con la camiseta celeste en las instancias señaladas, como Miguel Ángel Neira y Mario Núñez, que además de ser uno de los artilleros históricos del club, Mario Núñez ostenta el récord de ser el máximo goleador de la celeste en un campeonato nacional de Primera División, con treinta y cuatro goles en 1999 y el segundo a nivel mundial.
El 25 de mayo de 2014 la SD Eibar se convierte matemáticamente en equipo de Primera División para la temporada 2014-2015 tras vencer al Alavés por 1 a 0. Será el equipo con menor presupuesto de la categoría y con la ciudad de menos habitantes (27 000) en la historia moderna de la Primera División. El 13 de julio el TAD desestima el recurso del Elche CF por lo que ratifica su descenso y que la plaza en Primera División la ocupara la SD Eibar. El Elche CF acude a la justicia ordinaria para pedir medidas cautelares y así intentar mantener su plaza en Primera División, la juez del caso concede la cautelarísima al Elche CF el 17 de julio y cita alas partes Elche CF, SD Eibar y LPF para el 20 de julio, un día después el 21 de julio la juez no ratifica la medida cautelarísima que dictó por lo tanto vuelve a ser efectivo el descenso del Elche CF, la sanción del TAD. Con este ascenso, el Eibar comienza una época dorada de la mano de Garitano. Este modelo se trasladó al área deportiva, donde se apostó por la implantación fuerte y arraigada de los valores del SD Eibar en el vestuario.
En el mes de noviembre de 2016, coincidiendo con un partido contra el Real Club Celta de Vigo, se inauguró la nueva Tribuna Este del estadio, ampliando por primera vez en la historia el aforo por encima de los 7000 asientos, y generando nuevos espacios bajo la tribuna como el Museo, tienda oficial, aparcamiento subterráneo para 60 vehículos y nuevas áreas de servicios. Vuelve a la promoción de ascenso y tras cuatro años en Segunda B consigue subir a Segunda División tras derrotar al Alcoyano (quién lo eliminó del ascenso hace dos años) y al Real Oviedo en las dos primeras fase y al Hospitalet en la fase final. Al día siguiente Michael Carrick sería nombrado técnico interino, hasta que el 29 del mismo mes cuando el alemán Ralf Rangnick fue nombrado técnico interino hasta el final de la temporada 2021-22. Rangnick no pudo clasificar al equipo a la Liga de Campeones tras quedar sexto en la liga con 57 puntos, -obteniendo el United su puntuación más baja desde el establecimiento de la Premier League-. Sin embargo, los éxitos cosechados en esa primera vuelta no vieron su continuidad en la segunda, en la que una mala racha de resultados condena al equipo al 18.º puesto y a la pérdida de la categoría.